本人是985大学生物专业的学生，今年大3了，考研打算考生物分离工程或者生物化工

单就生物化工来讲，排名第一的好像是华东理工大学，国家重点专业，有博士点，有国家重点实验室，华东理工大学不是34所自主划线高校，也不是985，但211里不是第一也排的上前几了，地点在上海，相对来讲考研也不是太难
至于燃坦中国科学院研究生院，现在应该说是中国科学院大学，地位和实力当然没的说，就看你怎么选择了。
当然浙大，天大，清华这些学校生物化工都不错，一些所谓的专业排名相信你也能从一些网站上看的到。
关于选择院校方面我建议，如果你有实力，并且有信心的话，可以查一下各个院校的专业导师，选出你理想满意的导师后，多查一下，他的研究方向，项目，以及研究经费，和学科地位等型蚂来最终决定自己的最后选择
至于说就业还是考研，这完全取决于你自己的选择了，你如果觉得能找到好工作自己满意的话，也可以选择就业 ，当然考研是近几年的趋势，每年高居不下的考研人数还是能反映一定问题的，生物类专业最好的出路还是出国，毕竟国内生物领域还属于新兴科学，当然并不是重洋内外，还是希望楼主能多位国家做贡献的
生物分离工程我不太了解，不过微生物专业排名第一的应该是山东大学

全是肺腑之言啊，就是码字有点辛苦，皮租桐希望能帮到你！！！

作为你的学长，我得问你一下，你将来是打算蹲在实验室还是去企业？如果打算蹲在颤拆实验室，建议选分离工程，如果打算去企业，选后者，我是生含顷物技术的，不过我跨专业去学了经济学，说真的，咱们这个专业比较枯燥无聊，我同学现在大部分都在化工企业实谈洞陆验室。建议你考虑好，我是呆不住实验室，所以转了专业！不过选择选择生物了，工资和工作环境比较稳定，如果考的话，建议考中科院生物所吧，感觉不是很难！

武汉大学的可以