我在工厂做了一个月了 当初合同上说的是 必须做满3个月 然后才能提出离职申请 但是现在我

可以的，本身工厂的这种规定就是违法的，你可尘迟以提前三天向工厂里提出离职申请，如果厂方不批准，你可以在3天之后直接走，如果厂方不支付你工资，你可通过以下途径解决：
1．到劳动行政部门举报（通常是山氏劳动管理监察大队）。
2．也可以直接申请仲裁。
3．如果对仲裁结果不满意可以在拿到仲裁书后15天之内到法院起诉。
4．根据国家规定在仲裁或诉讼的时候，你可以要求除在规定的时逗兄散间内全额支付劳动者工资报酬外，还需加发相当于工资报酬百分之二十五的经济补偿金。

可以申请辞职，不能扣工资。

约定三个月是不合法的

不会。他扣你你就告他。根据劳动法，职工可以随世首时提出申请，如果单位不接受，就以书信形式寄到单位人事部，一个月后可自动离职，单位无权扣你任何东西。单位给你交社保了没？只要你上班一敬陆天单位都要交亮返顷，不管是不是实习期，要是没交，当地劳动监察大队一投诉一个准。

如果三个月有约定是试用期的话，你们双方是可以互辞的。行凯漏因为还没有转正，所以应孙埋该手续很快
如果合同里面没有约定有特殊的培训和试用期的违约的话。应该按实际上班天数进行档烂工资结帐
实在不行可以寻求法律援助，这个是免费的