当然会有关系的，因为你的驾驶证是C1E合证。（如两本驾照就不是这种情况了）
1、首先要看你的摩托车违章是什么性质，如果是一般超速或闯灯，只要交纳罚款就行了。
《安全法》第九十条 机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者二十元以上二百元以下罚款。本法另有规定的，依照规定处罚。
第一百零八条 当事人应当自收到罚款的行政处罚决定书之日起十五日内，到指定的银行缴纳罚款。
2、如果是严重情节的：
违反道路交通安全法律、法规的规定，发生重大交通事故，构成犯罪的，依法追究刑事责任，并由公安机关交通管理部门吊销机动车驾驶证。
造成交通事故后逃逸的，由公安机关交通管理部门吊销机动车驾驶证，且终生不得重新取得机动车驾驶证。
3、如果不及时接受处罚的话：
第一百零九条 当事人逾期不履行行政处罚决定的，作出行政处罚决定的行政机关可以采取下列措施：
（一）到期不缴纳罚款的，每日按罚款数额的百分之三加处罚款；
（二）申请人民法院强制执行。
除了要接受加处罚款外，你的C1E驾驶证不能正常办理每年的体检审验了。
建议去交警部门咨询
望采纳~~
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