A、种群间不能进行基因交流意味着种群基因库的改变，并不一定形成新物种，A错误；B、自然选择导致有利变异不断定向积累从而使基因频率定向改变，进化的根本原因是可遗传变异，B正确；C、人为因素和物种入侵都可能改变生物进化的速度和方向，C正确；D、种群基因频率的变化趋势能反映生物进化的方向，但不能反映可遗传变异的方向，因变异是不定向的，D正确．故选：A．
