rtpcr时提取rna的浓度和纯度要求:浓度20ng/ul以上足够了,如果用的是组织提取,浓度一般很高,可以达到几百甚至几千。如果你用的是病毒、少量细胞,浓度低一些也没有关系。
纯度需要用仪器测一下。260/280理论值应该有2.0以上,260/230值1.2以上基本合格。
RT-PCR:最重要的是RNA是否有明显降解,这个需要跑电泳看。一般来说28S应该比18S亮1.5-2.0倍,说明提取得不错。
反转录·聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)是将RNA的反转录(reverse transcription )和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。首先经反转录酶的作用从RNA合成 cDNA,再以cDNA为模板,扩增合成目的片段。RT-PCR技术灵敏而且用途广泛,可用于检测细胞中基因表达水平,细胞中RNA病毒的含量和直接克隆 特定基因的cDNA序列。作为模板的RNA可以是总RNA、mRNA或体外转录的RNA产物。无论使用何种RNA,关键是确保RNA中无RNA酶和基因组 DNA的污染。
提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA作为模板,采用Oligo(dT)或随机引物利用反转录酶反转录成cDNA。再以cDNA为模板经行PCR扩增,而获得目的基因或检测基因表达。
浓度20ng/ul以上足够了,如果你用的是组织提取,浓度一般很高,可以达到几百甚至几千。如果你用的是病毒、少量细胞,浓度低一些也没有关系。
纯度你需要用仪器测一下。260/280理论值应该有2.0以上,260/230值1.2以上基本合格。
最重要的是RNA是否有明显降解,这个你需要跑电泳看。一般来说28S应该比18S亮1.5-2.0倍,说明提取得不错。