扒开屁股，有两个小小的蛋蛋的就是公的，有的仓鼠蛋蛋比较明显可以这么看。
小仓鼠的话，公的肛门和生殖器距离远，而母的距离比较近。
行为上也可以分辨，公的性成熟之后会追着母的跑，把公仓鼠的笼子放在母仓鼠旁边，公仓鼠会扑过去咬笼子的，而母仓鼠就比较矜持了。
公鼠和母鼠的分别方法是用生殖器来判断。
1、母鼠的生殖器和肛门离的比较近，生殖器和肛门离的比较开，
2、成熟的公鼠会有突出的睾丸，黄金鼠、沙鼠、通心粉鼠 会非常明显，枫叶鼠比较不明显。
注：大多数人都是从小鼠开始养，小鼠因性器官没那么明显，所以不好区分。在此提供一种方便的分辨法：小公鼠因生殖器和肛门距离远，所以在两点间会有毛；小母鼠因距离近，所以两点间会没有毛。
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