肌肉萎缩的治疗方案取决于病因，应针对原发疾病制定治疗方案，但营养和锻炼贯穿始终。
急性期治疗
对于急性出现的严重肌肉疾病，可能会出现呼吸肌无力，导致呼吸困难甚至呼吸衰竭。对于此类患者需要在急诊或者重症监护室进行监护治疗。
一般治疗
对于系统性疾病如内分泌疾病、肿瘤、感染、颈椎病、腰椎间盘突出等，需要治疗原发疾病。
对于炎症性肌病，治疗的目标是抑制炎症和自身免疫反应，治疗方案需要专科医师评估后制定。
营养和锻炼
锻炼
最好避免肌肉萎缩的办法就是多使用，在安全范围内，增加针对肌肉力量的锻炼。
营养
保证每天足够的能量摄入，注意合理饮食搭配，营养均衡。每日所需能量约为25~35kcal/kg，具体还需要根据每日的能量消耗估算。此外，还可摄入一些营养肌肉的药物。
合适的治疗方法及早的进行治疗对肌肉萎缩的康复是很有帮助的。对患者病情应该及时得到治疗并且控制，考虑到患者的情况，建议中西医方法治疗效果好。同时肌肉萎缩患者合理调配饮食结构更有利于康复。早期患者应采用高蛋白、富含维生素、磷脂和微量元素的食物，并积极配合药膳。
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