生物肥料按微生物的种类划分为:根瘤菌、固氮菌、芽孢杆菌、光合细菌、纤维素分解菌、乳酸菌、酵母菌、放线菌和真菌。其中以根瘤菌的研究最深入、应用最广泛。当前我国生产上使用的菌种主要为根瘤菌、固氮菌、解钾菌等, 主要的生物肥料品种有根瘤菌肥料、固氮菌肥料、解磷菌肥料、硅酸盐细菌肥料等。
