A、由于亲代噬菌体已用32P标记，要研究该标记物的出现的部位，因此培养大肠杆菌的培养液不应含有32P标记的无机盐，故A错误；
B、单独以上一组实验能够证明DNA是遗传物质，但是不能证明蛋白质不是遗传物质，因此应设置用35S标记噬菌体的实验作为相互对照，故B正确；
C、基因分离定律适用于进行有性生殖的真核生物，病毒和细菌的遗传均不遵循该规律，故C错误；
D、如果保温时间过长，子代噬菌体会从大肠杆菌中释放出来，导致上清液中也会出现放射性，故D错误．
故选：B．
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