A、DNA复制、转录及翻译过程分别以DNA、DNA和mRNA为模板，都遵循碱基互补配对原则，A正确；
B、由于翻译在核糖体中进行，所以核基因转录形成的mRNA需穿过核孔进入细胞质中与核糖体结合，参与翻译过程，B正确；
C、DNA复制、转录和翻译过程分别产生DNA、RNA和蛋白质，它们的基本单位分别为脱氧核苷酸、核糖核苷酸和氨基酸，所以需要的原料依次是脱氧核苷酸、核糖核苷酸、氨基酸，C正确；
D、DNA复制只有一次碱基对之间氢键的断裂，而转录有两次碱基对之间氢键的断裂，第一次是解开模板DNA双链． 第二次是新合成的RNA链与模板链分离，D错误．
故选：D．
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