先来说一下你的意思是说比如一个CT的A相吧。说他的极性是正，意思是说S1端子作为其输出正极性端子来抽，S2端子作为输出负极性来抽，意思是啥呢，牵扯到电流的方向问题了，你比如说差动保护吧，差动保护所用的两侧的两个CT极性就得取反极性，意思是说一个取正，一个取负，这样电流方向相反，两个电流大小相等方向相反，相加值为0。继续回到你的问题上来，你的意思是说CT抽S1端和抽S2端来接会不会产生互感器一次极性相反的问题，从上面的解释你也差不多能明白了，你这样来想，一次侧接法已经固定了，电流就是从S1端流出再从S2端流入，那么你先接S1和先接S2当然不同了，电流方向会反180°的，极性对于二次回路来说会反的且电流不能开路。但是对于一次那边来说，不论二次咋接，都是不变的。
电流互感器一次侧的极性取决于一次回路，不会受二次回路接线的影响。
不明白你想问什么，请详细补充
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