A、染色体是易被碱性染料染成深色的物质，A正确； B、染色质和染色体是同一种物质在不同分裂时期的不同形态，B正确； C、一般情况下，一个染色体上有许多基因，不是只有一个基因，C不正确； D、染色体是由DNA和蛋白质组成的，D正确． 故选：C．
