按照签订劳动合同中的仲裁部门进行。如果是在A地签订的合同就到A地。
那方便，你就在那申请劳动仲裁。
《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》
第二十一条 劳动争议仲裁委员会负责管辖本区域内发生的劳动争议。
劳动争议由劳动合同履行地或者用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会管辖。双方当事人分别向劳动合同履行地和用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁的，由劳动合同履行地的劳动争议仲裁委员会管辖。
你的劳动合同履行地，就是B，也就是你的工作地点。A应该是公司的注册地或所在地。
一般由劳动合同履行地管辖。
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