关于古代皇子公主的制度。

大皇子、二皇子、三皇子、大公主、二公主

因为奴隶社会和封建社会都是男权社会，从父系氏族社会进化而来。按照儒家的传统，君君臣臣、父父子子，长兄如父等说法，是以男子排行为主，女子次之

是你说的第一种类型，男女分开排序。
还有，一般是皇长子，皇二子，长公主，二公主这么称呼的

应该是大皇子、二皇子、三皇子、大公主、二公主。
也就是公主分一类
皇子分一类，
在宋朝比如皇帝和一个皇子在一起就不会叫皇子，一般都叫皇儿
在清朝比如是八阿哥就叫老八，四阿哥就叫老四

以清代为例
皇子等级：
1、皇子未成年之前统一居住后宫，成年后方可出宫建府，未成年的阿哥除皇上特许外不可出宫。
2、皇子成年后便可封爵、依次为 和硕亲王 和硕多罗郡王 多罗郡王 和硕多罗贝勒 多罗贝勒 和硕固山贝子 固山贝子。
王爷等级：
1、和硕亲王：简称亲王。清朝宗室的第一等爵，宗室唯皇子、皇兄弟可以获得此爵位，一般都是世袭者。
2、多罗郡王：简称郡王，清朝宗室的第二等爵，皇子、宗室子，一般都是承嗣者。
3、多罗贝勒
4、固山贝子
5、奉恩镇国公
6、奉恩辅国公
7、不入八分镇国公
8、不入八分辅国公
皇女等级：
皇帝嫡女为固伦公主、但也有庶女被封固伦公主之例，如清高宗之固伦和孝公主，庶女为和硕公主。
和硕亲王嫡女为郡主、（和硕格格）庶女为郡君（多罗格格）。
和硕亲王世子、多罗郡王嫡女为县主（多罗格格）、庶女为县君（固山格格）。
多罗贝勒嫡女
封郡君（多罗格格）、庶女为乡君（格格）。
固山贝子之嫡女为县君（多罗格格），庶女不受封，称宗女（格格）。
入八分镇国公、入八分辅国公之嫡女为乡君（格格），庶女不受封，称宗女。
不入八分公以下之女皆不受封，只称宗女。

明朝皇室爵位：
亲王（皇帝之子一律授予亲王爵位）
郡王（亲王之长子世袭亲王，其余诸子全封郡王）
镇国将军（郡王之长子世袭郡王，其余诸子全封镇国将军）
明朝公主都是金册 二千石。不像清朝有固伦 和硕之分。
明制，皇姑曰大长公主，皇姊妹曰长公主，皇女曰公主，俱授金册，禄二千
石，婿曰驸马都尉。亲王女曰郡主，郡王女曰县主，孙女曰郡君，曾孙女曰县君，
玄孙女曰乡君，婿皆仪宾。郡主禄八百石，余递减有差。郡主以下，恩礼既杀，无足书者。今依前史例，作《公主传》，而驸马都尉附焉。