有可能，因为没有安装系统的时候，ISO文件在一个压缩包里，并且有加壳程序，有可能查不出来，建议把ISO文件解压缩后，再检查一下，看一下是不是有病毒，还有，安装完后再杀一遍，看一下是不是有病毒。再次，你那个病毒是在C盘还是在别的盘上？
（如果这些方法不行，从正规网站上下一个纯净版试试，如果不行，就保存重要文件，把硬盘深度格式化，重新分区，再安装）
软件未运行前，加壳等方法能一定程度绕过360检查，但最终运行时360还有一道坎能防止一部分病毒破坏，就造成你说的情况。
iso是镜像文件，里面的文件没安装，通常是查不出的，因为在那个文件里木马没法起作用的，变成系统后，木马就能起作用
哥们你好这情况应当是那个镜像文件有问题，为了安全建议你删除它为好。
我费很大劲下载了一个winxp sp3的ghost iso文件，360查出里面有一个威胁wup说明这个系统盘被插入病毒了，建议去正规大型的网站下载XP安全点 wupdmgr
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