温度是影响杂草萌发的重要因素，不同杂草种子或营养繁殖器官的萌发所需积温不同，如稗草，需积温100～120℃，鸭舌草需积温120～150℃等。多年生杂草营养繁殖器官萌发所需积温也不同，如水莎草，需积温100～120℃，矮慈姑需积温250℃，眼子菜需积温300℃，野荸荠需积温400℃，因此，除水莎草发生较早外，其余多年生杂草发生均略迟。
另外，各种杂草发芽温度均有一个范围，即最高温度、最低温度及最适温度，这种范围一方面反映出杂草种与种之间发芽对温度要求的差异，同时也表明同一种杂草种子萌发对温度要求也有差异。
据试验资料，稻田杂草种子萌发最低温度约在10～15℃，最适温度在20～30℃，最高温度为35～40℃。
某些杂草，发芽最低温度较低，如稗草、异型莎草等，起点温度在10～13℃左右，因而萌发较早，在前期变温较大的条件下，萌发较快，生长迅速，在与水稻及其他杂草竞争上处于较高的起点，往往成为为害较重的前期高秆杂草。牛毛毡萌发起点温度亦较低，在10～12℃，因而能提前抢占空间。一些一年生双子叶杂草，如节节菜、水苋，萌发起点温度较高，在16℃以上，因而萌发较迟，往往表现为荫生和中后期杂草。
多年生杂草的地下根茎萌发的最低温度均较其种子萌发为低，大都在15℃以下，因而萌发早，极具竞争优势，而种子萌发最低温度则较高，如眼子菜在20℃左右，萌发迟、生长弱，在稻田杂草竞争中显得并不重要。
同一类杂草中，在最低温度发芽的虽是少数，但往往是最健康的种子，又由于萌发早，具有较大的生存空间，萌发初期相对生长较慢，因而扎根深、生长较壮，极具竞争优势。在田间，除前期发生的稗草、莎草科杂草往往高出水稻外，还有一批一年生双子叶杂草如丁香蓼、鳢肠、水苋等长势较好，与水稻的相对高度可达0.8～1.0以上，这些都是在最低温度下萌发的少量杂草，这些杂草生长发育好、结实率高，在种的繁殖与传播上具有重要地位。在防除中，也往往因草龄较大而成漏网之草。
萌发的最适温度，意味着此时发芽数量多、速度也最快，如其他条件适宜，极易出现出草高峰。最适温度，对各类杂草及同一类中的大多数种子差异不大，这时应是防除的重点。
最高温度条件下萌发的杂草，常常是质量较差的种子，萌发生长虽较快，但较瘦弱，由于出草高峰已过，已不具竞争优势。
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