军工保密资格认证申请程序是怎样的？

参考《武器装备科研生产单位保密资格审查认证管理办法》
1、证明材料准备好；
2、公司按照相关标准运行保密体系；
3、编制申请书，逐级审查后递交；
4、现场审查，通过后等待发证。
你还是先看看认证管理办法，应该对你有很大帮助

军工保密认证申请：策划建立军工保密体系，实施体系，向上级部门申报，现场审查。
可参考http://www.yhtimes.net
上面有参考信息。
或可致电13718081936

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先取得意向合同和等级建议表
然后对照管理办法和标准建立保密管理体系
之后递交认定申请
审查过后整改完成给你证书。
核心是建立保密管理体系，措施要有效。
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第十一条申请保密资格的单位应当具备以下基本条件：
（一）中华人民共和国境内登记注册的企业法人或事业法人；
（二）承担或拟承担武器装备科研生产的项目或产品涉密；
（三）无外商（含港澳台）投资和雇用外籍人员，国家有特殊规定的除外；
（四）承担涉密武器装备科研生产任务的人员，应当具有中华人民共和国国籍，在中华人民共和国境内居住，与境外人员（含港澳台）无婚姻关系；
（五）有固定的科研生产和办公场所，并符合国家有关安全保密要求；
（六）1年内未发生泄密事件；
（七）无非法获取、持有国家秘密以及其他严重违法行为。
第十二条申请保密资格的单位，应当填写《武器装备科研生产单位保密资格申请书》（以下简称《申请书》），并提供以下材料：
（一）《申请书》；
（二）工商营业执照正本、副本（复印件）；
（三）组织机构代码证书（复印件）；
（四）公司章程；
（五）上一个年度财务验资报告；
（六）科研生产场所产权证书或租赁合同（复印件）；
（七）合同甲方出具的研制项目或产品的密级证明，或者合同意向单位出具的合同意向证明及密级证明；
（八）国家军工保密资格认证委要求提供的其他材料。