现有一质粒,如何用Vector NTI分析该质粒的抗性?

卡那抗性如何确定?
2024年11月18日 19:33
有3个网友回答
网友(1):

假设现在只知道序列而不知运滑道质粒名
使用Alberta大学的在线程序PlasMapper,输入兆悄橡序列之后确保Feature Options里面Selectable Marker选中(其它选项不需要都可以去掉)。点击Graphic Map生成质粒图谱,如果出现标记kan2 marker就是卡那抗性。

另一种方法是去NCBI做BLAST使用nucleotide blast选择nucleotide collection数据库,找到最相近的载族旁体名,然后去baidu/google相应的载体图

网友(2):

为什么要用软件分析,太麻烦,还得必需知道序列。
直接搜一下质粒名或者他的来源质粒就知道了

网友(3):

质粒图谱上,应该有吧