会有冲突，原则上应当在中标单位缴纳了交易中心的综合服务费之后才能签订合同，目前实际已经签订了合同，如果不缴纳综合服务费，交易中心会向招标人或招标代理机构追缴相关费用，如果拒绝缴纳，那么肯定影响以后在交易中心的项目。
