准格尔盆地周围有高山，如天山、阿尔泰山等，使得大西洋和北冰洋的暖湿水汽通过缺口进入，如额尔齐斯河谷、额敏河谷以及阿拉山口，在暖湿水汽的影响下，准格尔盆地及周围山地能够得到较为充沛的降水。
盆地西侧有几处缺口,如额尔齐斯河谷，额敏河谷及阿拉山口。大西洋和北冰洋的暖湿水汽由缺口进入，为盆地及周围山地带来降水，冬季气候寒冷，雨雪丰富。
