由于免疫组化的蛋白一般没有变性保留着二级或三级结构，抗体较难结合，所以抗体效价需要较高，而western的蛋白都是变性的，蛋白决定簇基本暴露，所以不需要很高效价的抗体。所以抗体区别在于效价的高低，一般能用于免疫组化的基本都能用于western blot。
ELISA（酶联免疫吸附试验Enzyme linked immunosorbent assay）用到了免疫学原理和化学反应显色，待测的样品多是血清、血浆、尿液、细胞或组织培养上清液，因而没有用到组织包埋、切片等技术，这是与免疫组化的主要区别，操作上 开始需要将抗原或抗体结合到固相载体表面，从而使后来形成的抗原-抗体-酶-底物复合物粘附在载体上，这就是“吸附”的含义。
WB （蛋白质印迹Western Blot）先要进行SDS-PAGE，然后将分离开的蛋白质样品用电转仪转移到固相载体上，而后利用抗原-抗体-标记物显色来检测样品，可以用于定性和半定量。
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