首先，可以明确一点，指纹是可以作为证据使用的。根据《公安机关办理刑事案件程序规定》第五十六条规定， 可以用于证明案件事实的材料，都是证据。
证据包括：
(一)物证;
(二)书证;
(三)证人证言;
(四)被害人陈述;
(五)犯罪嫌疑人供述和辩解;
(六)鉴定意见;
(七)勘验、检查、侦查实验、搜查、查封、扣押、提取、辨认等笔录;
(八)视听资料、电子数据。
证据必须经过查证属实，才能作为认定案件事实的根据。
其次，就该问题而言，光凭借指纹就认定当事人有罪，也是不可能的。侦查机关会依法侦查，并核实相关证据的真伪。
他们还会考虑你进入现场原因、案发时候你不在现场的人证等、否则不会你是脱不了干系的
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