32位与64位的Windows，功能上无区别。但内核上有些区别。
如今的兼容性没有太大问题，如果处理器支持64位，安装64位Windows性能会更好。
64 位系统有时缺乏对应的软件，那些软件是写给 32 位架构。最严重的问题是不兼容的驱动程序。尽管大部分软件可运行于 32 位兼容模式（又称作模拟模式，即微软 WoW64 技术），其通常无法运行驱动程序（或类似软件），因为程序通常运行于操作系统和硬件之间，在此直接模拟无法使用。许多开放源始码软件封包可简单的从源始码编译为可运行于 64 位环境操作系统，如 Linux。所需的条件是供给 64 位机器的编译器（通常是 gcc）。目前大部分 64 位版本的驱动程序还不能用，由于缺少可用的驱动程序，所以使用 64 位操作系统会有挫折。
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