SNP功能注释怎么做

2025年03月19日 06:41
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该分析模块是对基因组预测编码基因后的基因本体功能分析。主要内容包括(1)通过NCBI NR, NT, Ensemble GO 等国际权威数据库识别新基因的功能。(2)结合其他NSAM方案,如比较基因组学的诸多分析方案,获得近源物种的同源基因,得到该当前物种的特有基因和可能参与的新功能,新代谢通路和信号转导通路。如果配合SNP和进化分析,可以获得基因的选择压和进化距离,进而分析该物种的进化起源。(3)比较多物种基因组中基因成分在gene和gene cluster层面上比较多物种基因成分的共性和差异性获得该未知物种不同条件下的转录组数据,分析转录组数据中基因的功能本体。