清朝当时已经全部撤军，吴三桂为何还要对明室赶尽杀绝呢？

吴三桂是个反复无常的人，他深知这种人难以得到信任，他当时在李自成的压力下才向满清借兵，却被狡猾的多尔衮威逼利诱最后彻底投降。满清做大做强后对吴三桂并不放心，面对昔日亡国之君永历皇帝，清朝故意撤退，目的就是要考验吴三桂。无路可走的吴三桂只得痛下杀手，成就自己留下了千古骂名。当然，吴三桂之所以冒天下之大不韪杀害永历皇帝，还有自己的小九九。

崇祯死后，南明政权向南逃窜。吴三桂虽然投降满清却仍然得到南明政府的承认，名义上还是大明的将军。清军入关之后分兵两路，一路是吴三桂等将军为首主要追击李自成，另一路是清军亲王率领八旗南下进攻南明。在南明政权、李自成政权与张献忠政权相继崩溃后，平西大将军吴三桂才和清军在云南会师。南明永历皇帝迫不得已逃亡缅甸。

满清朝廷一看南明已经掀不起大浪，只留下吴三桂镇守云南，八旗子弟全部撤军。这就给吴三桂出了个难题。满清朝廷的用意很明显，就是拿永历皇帝的人头换忠心。此时的吴三桂已经死心塌地投靠了清廷，他厚颜无耻地上书坚持要将永历皇帝斩草除根。当然，吴三桂是个野心勃勃的人，他还有自己的小九九，就是效仿明朝初期的沐英世代镇守云南。而要镇守云南，就一定要铲除永历皇帝的势力，一劳永逸地消除所有的潜在威胁，而这一切只能借助清廷之手。

永历帝在广东即位称帝，还没过上几天安稳日子，就被如狼似虎的清军穷追猛打，一路从广东逃到广西、从广西逃到贵州，从贵州逃到云南，从云南逃到缅甸，早已疲惫不堪、魂飞魄散。不过，到了缅甸后被缅甸王莽达所收留。吴三桂却追着他不放。先是上书清廷，后又带兵深入缅甸围剿，最终将永历帝及太子等人全部被自缢于云南五华山西侧的蓖子坡金蝉寺。后来，人们根据蓖子坡的谐音，将此地称为“逼死坡”。永历皇帝临死前质问吴三桂：“汝非汉人乎？汝非大明臣子乎，何甘为汉奸叛国负君若此？汝自问汝之良心安在？”吴三桂听后大惊，不由自主的瘫倒在地，不敢与他直视。他狼狈的从地上爬起来，退出了房外，不敢再见永历帝的面。

吴三桂希望通过杀害南明永历皇帝获得清廷的信任，果然如他所愿，他后来被封为平西王，镇守云南，成为云南一霸。但作为一个反复无常的小人，清廷却始终对他不放心。全国局势稳定后，清廷就着手裁抑吴三桂的权势，剥夺了他的兵权。及至后来，康熙皇帝更是发动撤藩，将吴三桂逼反，从此他走上了不归路。

吴三桂对明室赶尽杀绝是为了表示自己的诚意，虽然被封王，但毕竟自己是个降将，只有把明室赶尽杀绝才能获得清朝的足够信任，向清朝表达自己的忠心。

为了使自己成为明朝的正统，也可以以此来胁迫清朝封赏自己，是为了谋取自己的利益。

吴三桂应该也是有自己考量，吴三桂叛明投清当时被很多人骂，既然做了何不赶尽杀绝。