两个户口补办身份证时采集指纹会被发现吗

　　原则上来说，会的：
　　1，根据我国《户口登记条例》第六条的规定，每个公民只能在一个常住户口所在地登记为常住人口；
　　2，双重户口是不允许的，当事人应带上本人后办的户口本及身份证，去对应的派出所办理户口注销手续；
　　3，如果当事人后办的户口才是常用户口的，可以事先说明实际情况，并根据派出所工作人员的提示，妥善处理后续事宜。

　　一，《中华人民共和国户口登记条例》的规定：
　　第六条公民应当在经常居住的地方登记为常住人口，一个公民只能在一个地方登记为常住人口。

　　二，《中华人民共和国居民身份证法》的规定：
　　第三条 居民身份证登记的项目包括：姓名、性别、民族、出生日期、常住户口所在地住址、公民身份号码、本人相片、指纹信息、证件的有效期和签发机关。
　　公民身份号码是每个公民唯一的、终身不变的身份代码，由公安机关按照公民身份号码国家标准编制。
　　公民申请领取、换领、补领居民身份证，应当登记指纹信息。

首先，一个人按照正常程序是不会有两个户口的，一个人有两个户口是一种违法存在。其次，如果你是在办理港澳通行证时户口在A地，办理身份证时户口在B地，这是正常的，那么你就没有必要担心了。