有两种方案：
增加一个界面程序，不用修改a.exe，建议使用MFC实现，比较方便，而a.exe通过界面程序调用（使用CreateProcess函数），而输出结果使用管道的方式使界面程序，可以输出到一个文件，或者一个命名管道，前一种比较简单。
因为你有源代码，直接改为一个MFC程序，将原来的命令行输入改为函数的参数输入，然后输出转换为字符串即可在界面显示出来。
注意，如果你要发布程序给其他人的话，需要附上vs2008（或其他版本）的可重发布包，否则你引用了MFC，对这个有依赖，而其他机器没有这个运行不了你的程序。当然如果你熟悉纯Win32开发的话，不用MFC也可以开发界面程序的，就没有这个问题了。。
Qt或MFC都可以
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