（一）在机构设置和管理上混乱。
一是内部机构增设不够统一。
二是派驻机构管理不统一。
（二）在围绕中心、服务大局方面介入过多。按照党章规定，各级纪委是党的路线、方针、政策的捍卫者和维护者，是反腐倡廉工作的推动者、组织者和践行者，主要任务是运用组织和法律手段确保党纪执行，政令畅通，推动和组织反腐倡廉各项工作。但是，在中央纪委未提出转职能、转方式、转作风的要求之前，各级纪检监察机关参与职能职责外的中心任务普遍存在“三多”现象。一是参与各种议事领导小组会议多。
二是参与临时性工作的检查多。
三是承接和分管事项多。
（三）履行职能职责效果有待提升。教育、监督、惩处、保护是纪检机关的重要职能，但是有的地方却把监督、惩处与教育、保护干部割裂开来，甚至对立起来。
一是注重教育形式，不注重教育效果。
二是注重制度建设，不注重制度执行。
三是注重案件查办，不注重纪律处分。
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