公元前110年（西汉元封元年），儋耳设郡，郡治在高麻都南滩浦，即今三都镇旧州坡。
公元1109年（北宋大观三年），高麻都人符确金榜题名独为海南第一进士。
公元1512年（明正德七年），儋州仁丰乡除了高麻都，尚有曾刘都和薛官都，一地三都。
1939年（民国28年），儋县伪治安维持委员会将区公所和墟镇迁移现址，取名“三都墟”。
该镇1950年5月为儋县第五区。
1958年为木棠公社三都大队。次年由木棠公社分出，成为三都公社。
1983年底取消公社体制，改为三都区。
1987年初，改区为镇。
2013年10月9日，划入洋浦经济开发区管辖。
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