没影响，都在当地教育局备案，参加全省的学业水平考试，通过后发全省统一的高中毕业证。只是学校性质不一样而已，对学生没影响
私立高中一般都有较严格的考试和面试，不是给钱就上的，你就是过了N1，也要加强日语，否则听课也吃力。
