博物馆内设一个序厅和三个展厅，共展出良渚文化器物400余件（组）。序厅以赵朴初先生题写的“文明曙光”四个鎏金大字最为醒目，整个序厅的墙面用块石叠砌成壁，并施以不同的颜色分别示意三个社会发展阶段：最下层代表的是新石器时代晚期，最上层代表的是夏商周三代青铜文明时代，中间一层突出体现了良渚文化时期的玉器文化，每层上面都刻有各个时期的代表性纹饰与器物。石壁上嵌着时任全国政协副主席赵朴初的题词——“文明曙光”，作为基本陈列的名称，为全馆所展示内容起到提纲挈领之意。
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