A、:DNA分子每条链的其中一端含有一个游离的磷酸基,A错误;B、DNA分子中A:T:G:C=3:3:7:7,其中腺嘌呤有200× 3 20 =30个,B错误;C、一条链上A:T:G:C=1:2:3:4,则另一条链上A:T:G:C=2:1:4:3,所以DNA分子中A:T:G:C=3:3:7:7,其中腺嘌呤有200× 3 20 =30个,C正确;D、DNA分子中含有100对碱基,则碱基排列方式共有4100种,D正确.故选:CD.