《农村宅基地管理办法》上有规定的，宅基地申请被批准以后，如果在两年以内没有在这块宅基地上盖起房子的，则该批准文书（手续）自动作废，作为村委会是可以另行处置的。你的那个“很多年前申请了”的宅基地，应该超过法定年限了吧？
从行政角度看，你的证如果系合法有效，可主张排除妨害
