卵巢囊肿的性质很多，怎么治疗要看具体什么性质的囊肿，囊肿的大小，病程，变化情况，以及年龄这些综合判断。一般实性包块是必须手术的，囊实性大都也需要手术。单纯囊性包块，又比较小，首次发现，可以观察2-3个月经周期，卵巢上经常有生理性囊肿，来完月经会消失。如果短时间内变化很大，增长迅速，大都需要手术。观察一段时间基本没有明显变化的可以定期复查。能药物治疗的，一般只有炎症导致的囊肿。怀疑生理性囊肿，也可以用孕激素治疗一个月看看。
