水蜜丸与大蜜丸最大的区别就是粘合剂，水蜜丸是通过加水炼制的蜂蜜进行药粉粘合，节约了蜂蜜的成本，也更易于贮存。我国南方地区由于气候特点，生产水蜜丸比大蜜丸更多。
从药效上水蜜丸和大蜜丸基本是一致的，水蜜丸相比于大蜜丸容易服用，也更容易保存。但药性往往没有大蜜丸柔润。此外，由于水蜜丸中蜂蜜的含量较少，对血糖控制有要求的人可以酌情选用。
二、水蜜丸
水蜜丸的历史远没有大蜜丸悠久，是解放后我国药剂工作者根据水泛丸制作的原理改进而来。水蜜心丸的特点：生产效率高、易吞服、易保存。
三、大蜜丸
蜜丸，是指药材细粉用蜂蜜作为粘合剂制成的丸剂，根据大小和制法又可分为大蜜丸和小蜜丸。大蜜丸的特点是：药性缓和、崩解稳定、服用较麻烦。
一、大蜜丸以前往往用蜡纸、玻璃纸或塑料袋包装，现在则有一些蜜丸是用蜡封塑料硬壳作为包装。
二、大蜜丸易于保存，因为蜂蜜具有保鲜性，经过炼制过程含水量少，不需添加药用防腐剂，所以保质期长。
但是大蜜丸在服用时由于其体积和口味，嚼服口感较差，所以在服用时可以把它搓成小丸，和水吞服。
以上是两者的区别，可以根据个人而定
从外观来看，水密丸是硬硬的小颗粒，大密丸是用蜡壳包裹的软药丸。如果是同一个方剂，疗效是一样的，选哪个都可以。
水蜜丸就是通过加水蜂蜜进行药粉粘合。节约了蜂蜜成本。生产效率高，也更容易贮存。大蜜丸是药粉以蜂蜜为粘合剂制成的丸剂。药性缓和，柔润。从药效上水蜜丸和大蜜丸基本是一致的。水蜜丸更易服用，大蜜丸服用较麻烦些。根据自己的情况选择。
大蜜丸和水蜜丸就是剂型不同，大蜜丸需要以中药材的细粉入药，为了使得药效更加确切精准，需要极大限度地保留细贵药材、滋补类药材、易挥发性药材及各原料药材所含的有效成分。另外大蜜丸宜于消化吸收，尤其是脾胃虚弱的老年人、儿童是更适合服用大蜜丸的
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