A、根据实验课题可知，本实验的自变量是不同浓度的生长素类似物溶液，因变量是生根数量，A正确；
B、实验开始前进行预实验是为进一步的实验摸索出较为可靠的探究范围，以避免由于设计不当，盲目开展实验，B正确；
C、生长素只能从形态学上端运输到形态学下端，并且只有形态学下端能够生根，因此应将枝条的形态学下端浸泡在生长素类似物溶液中，C正确；
D、芽能产生生长素，生长素能够促进扦插的枝条生根，因此一般扦插所用枝条均带有一定数量的芽，D错误．
故选：D．
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