当然是主管部门提出啊,主管部门是你直属部门,人事部只是办理手续的,所以你需要向主管提出书面辞职,同意后就可以移交到人事部门处理,
一般都是先跟主管领导说一下,再到人事申请。管离职的是人事,离职之前工作交接什么的都需要跟主管领导沟通。