双方打架斗殴一方轻微伤，经派出所调解签订协议，另一方不赔偿怎么办

可以再请派出所出面，要求对方按当初的调解协议赔偿。如果还是不能解决问题或对赔偿结果不满意的话，可以向法院起诉处理。

根据相关规定，派出所要对打人者拘留罚款，告知受害人向法院起诉要求赔偿损失。
见：1、《治安管理处罚法》第九条　对于因民间纠纷引起的打架斗殴或者损毁他人财物等违反治安管理行为，情节较轻的，公安机关可以调解处理。经公安机关调解，当事人达成协议的，不予处罚。经调解未达成协议或者达成协议后不履行的，公安机关应当依照本法的规定对违反治安管理行为人给予处罚，并告知当事人可以就民事争议依法向人民法院提起民事诉讼。
2、《公安机关办理伤害案件规定》第三十九条 经调解当事人达成协议并履行的，不予处罚。经调解未达成协议或者达成协议后不履行的，公安机关应当对违反治安管理行为人依法予以处罚，并告知当事人可以就民事争议依法向人民法院提起民事诉讼。
3、《公安机关办理行政案件程序规定》第一百六十条 调解达成协议并履行的，公安机关不再处罚。对调解未达成协议或者达成协议后不履行的，应当对违反治安管理行为人依法予以处罚；对违法行为造成的损害赔偿纠纷，公安机关可以进行调解，调解不成的，应当告知当事人向人民法院提起民事诉讼。