首先你要看协议背面贴的违约金的条子你签字了没有，如果签字了就属于违约了，至于档案和户籍的问题和这个没有关系，现在的单位除了国企，大部分单位都不会要档案也不会管理你的户籍。
鉴于你现在的情况如果你有新的单位了可以再找系里面要一份协议当然是需要购买的，然后可以继续签其他公司。在他手里面的协议可以不要，协议本身没有什么约束力，协议不等同于合同。但是如果你在违约金条上签字了公司完全可以和你要违约金，你也可以不给，没有什么事情的，找学校 找老师和你都没有什么直接关系，你现在和学校老师的关系是平等的，不要再把自己当成小孩子。
希望我的回答对您有帮助，谢谢！！
这个你可以找你的老师，请他帮忙解决，比如导员和学校就业指导中心的，我记得我毕业的时候老师说过就业协议一般不具有法律效力，而且就算是签了劳务合同也不需要交违约金，提前一个月申请离职就行了，像你现在又没有合同也不是正式员工，他们完全是在讹诈。
找学校你又怕什么，学校只不过为了就业率希望学生都赶快找工作签协议，没什么好怕的。
只要你能在老师那拿到新的协议书就行
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