关于琼脂糖凝胶电泳图片分析

2024年11月17日 04:24
有3个网友回答
网友(1):

条带分开的程度看你实验的需求。如果你的Marker相邻两个条带相差100bp,而你的样本阳性结果和多带一个内含子的假阳性结果只差50bp(比方说你在做反转录PCR实验)那你当然需要分清楚一些。否则的话只要看得清楚你的样本条带是位于那两个Marker条带之间就可以了。

想要分开些跟胶厚度,点样都没有关系。提高琼脂糖浓度确实有影响,但不是一个线性的关系,琼脂糖浓度决定哪个大小范围的分得最开,不是所有条带都相同程度的分开,唉,看摆渡百科吧
“ 2、 琼脂糖浓度
一个给定大小的线状DNA分子,其迁移速度在不同浓度的琼脂糖凝胶中各不相同。DNA电泳迁移率的对数与凝胶浓度成线性关系。凝胶浓度的选择取决于DNA分子的大小。分离小于0.5kb的DNA片段所需胶浓度是1.2-1.5%,分离大于10kb 的DNA分子所需胶浓度为0.3-0.7%, DNA片段大小间于两者之间则所需胶浓度为0.8-1.0%。”

选定琼脂糖浓度的情况下,跑得时间越久分得越开。

在电泳开始时使用低压有利于条带清晰,是因为点样之后样品内分子是胡乱排列的,加上电压之后才统一方向排列好。所以一小段时间的低压让它们都排列好,再转高压能够同时起跑。不然的话好比起跑线上有些人背对着终点站有些人面对有人侧对,结果一声枪响,本来同样速度的人跑出不同的结果来--同样大小的分子跑出来不在严格一条线,条带当然不完美咯。
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哇,不好意思跟蛋白质电泳搞混了。其实一般不用放低压啦,尤其你才跑30分钟。不过你的电压比我高很多。我一般是100V跑45分钟,但是电压跟胶的大小有关啦。只要跑出来结果没问题,就不要随意改动实验条件了。

网友(2):

能看清楚就行了,不必分得很开。

你想要分得开的话只需要延长跑胶的时间,只要你的胶足够长,条带就能被拉的很开,但是这样有什么意义?完全是浪费时间。

网友(3):

楼主说的应该是提高条带的分辨率。

可以采用较大的胶浓度来处理。在电泳时,可以先低压电泳几分钟,再高压电泳分离,这样也可以使条带变得窄而锐利,便于观察。