我现在电脑的系统在固态硬盘里，还装了个机械硬盘，请问

重装系统就可以解决了，系统U盘制作及重装系统的操作步骤为：
1.制作启动U盘：到实体店买个4-8G的U盘（可以要求老板帮忙制作成系统U盘即可省略以下步骤），上网搜索下载装机员U盘启动PE制作工具，将U盘插入电脑运行此软件制作成启动U盘。
2.复制系统文件：上网到装机员论坛下载WINXP或WIN7等操作系统的GHO文件，复制到U盘或启动工具指定的U盘文件夹下。
3.设置U盘为第一启动磁盘：开机按DEL键（笔记本一般为F2或其它）进入BIOS设置界面，进入BOOT选项卡设置USB磁盘为第一启动项（注：部分电脑需要在此时插入U盘进行识别才能设置）。
4.U盘启动并重装系统：插入U盘启动电脑，进入U盘启动界面按提示利用下载来的GHO文件进行克隆安装。
5.如果有系统光盘（没有也可以去电脑商店购买），则将系统光盘插入光驱，开机后按DEL键（笔记本一般为F2或根据屏幕底行提示字符）

无需对系统做任何改动，直接安装机械硬盘即可。
需要将固态硬盘连接到第一个SATA接口，将第二块硬盘连接到后面的SATA接口。
如图所示：

主板上有4个SATA接口，将固态硬盘接到SATA2_0上，机械硬盘接到后面的sata接口就可以了。
机械硬盘的安装
1、将机械硬盘放入机箱内托盘中，并用螺丝固定。

2、将电源线和数据线连接到硬盘上。

这样整个连接都完成了。

只要U盘引导后，运行ghost，能看到机械硬盘就能安装

你的意思应该是系统迁移或者说拷贝系统吧，这种方法网上可以搜得到，一般是借助某些数据迁移软件实现的。这种形式可以避免重装系统的麻烦，但有可能导致系统不稳定不兼容，其实还不如重装系统。
可以到得得系统官网查看系统相关问题的教程。

可以。不过启动顺序BIOS需要重新设定。不然还是从原来的设备启动