由于基因型为AaBbCCDd的个体中含有三对等位基因,如果这三对等位基因分别位于不同的同源染色体上,则在减数分裂过程中,最多可产生23=8种配子.因此,基因型为AaBbCCDd的个体,1000个初级精母细胞可形成精子8种4000个.故选:C.